Alkuperä
Charles Darwin jäljitti maltankoiran alkuperän vuoteen 6000 ennen ajanlaskumme alkua, joten se on yksi vanhimmista tunnetuista roduista. Se kuuluu Välimeren alueelta kotoisin oleviin bichonrotuihin, ja Rooman Maltan-kuvernöörillä Publiuksella tiedetään olleen maltankoiraa muistuttava Issa-niminen koira jo ajanlaskumme ensimmäisellä vuosisadalla. Rotu on ollut kuninkaallisten ja aristokraattien suosiossa läpi historiansa, ja se on kuvattu myös taideteoksiin kuninkaallisten, muun muassa Englannin Elisabet I:n, seurassa. Marialla, skottien kuningattarella, kerrotaan olleen mestaushetkellään maltankoira piilossa helmansa suojassa.